生物安全无尘车间项目不仅需要控制实验室房间的空气清洁度，还需要控制其气流，避免实验室人员被感染的可能性。因此，生物安全实验室的工程设计需要达到清洁度。同时，实验室为负压，实验室内的所有气体、细菌等微生物通过排气过滤排入室外大气。由于负压净化室项目能耗大，一般生物安全实验室的空气净化工程系统规模较小，要求较高，施工难度较大。
工业无尘车间项目和生物安全无尘车间项目选择完全不同的空气净化工程系统，一般工业无尘车间项目相对较大，除非特殊商品生产区域会发出一些有毒有害气体或气味无尘车间车间需要排气，其他无尘车间车间不建议排气，可使用无尘车间工程回风系统和补充新鲜空气系统，实现无尘车间车间新鲜空气，保持清洁节能（减少冷损失等）。
工业无尘车间级别分为许多类别，包括几乎所有类别ISO无尘车间级别参考表中所有无尘车间级别要求。
由于工业无尘车间广泛应用于工业无尘车间，青岛无尘车间的清洁设计一般为10-100个无尘车间，1000-100000个无尘车间项目是日常生产车间常用的工业无尘车间水平。食品、化妆品、制药等工业无尘车间的常见水平一般在30-10万之间。
100级洁净室工程技术或层流罩、100级超净工作台用于灌装、内包厢、无菌室、微生物检测等核心生产区，FFU空气净化器等净化设备可以代替小型局部100级净化室项目，产生符合实验室操作的小型100级洁净区。
